O Laboratório de Sistemática Vegetal (LSV) ocupa uma área de 81,47m² e desenvolve projetos de pesquisa com foco no conhecimento e o uso sustentável da biodiversidade fornecendo base teórico/prática das técnicas moleculares e tecnologias de bioprocessos para estabelecer o desenvolvimento de produtos oriundos da biodiversidade. Além disso, desenvolve projetos de pesquisa com foco em Conservação vegetal, incluindo revisões taxonômicas para fornecer banco de dados para implementação de Políticas Públicas para conservação das espécies e de formação de unidades de conservação. Os trabalhos realizados pelo laboratório incluem estudos filogenéticos da flora neotropical e estudos de bioprospecção de espécies vegetais.  Para isso, são realizadas análises morfológicas, moleculares, fitoquímicas e microbiológicas.