O Programa de Pós-Graduação conta com bolsas de mestrado e doutorado oriundas da CAPES e do CNPq, além de bolsas vinculadas a projetos de pesquisa em parceria com a FAPESP, outros órgãos de fomento e o setor privado. A disponibilidade dessas bolsas é variável e está sujeita à oferta institucional no momento do processo seletivo. A concessão das bolsas está condicionada à aprovação do(a) candidato(a) no processo seletivo e à sua classificação na etapa de seleção de bolsistas. O Programa também adota uma política de incentivo à equidade, por meio de editais específicos voltados ao apoio de candidatos(as) em situação de vulnerabilidade socioeconômica e pertencentes a grupos historicamente sub-representados na pós-graduação.

Adicionalmente, o PPG mantém parcerias institucionais que podem viabilizar descontos para fisioterapeutas credenciados no CREFITO-3, colaboradores do Hospital Alemão Oswaldo Cruz ou do Sancet Medicina Diagnósticos.