Desde o início de suas atividades na Universidade de Mogi das Cruzes, o LAGOAA vem desenvolvendo trabalhos de pesquisa e prestação de serviços com a inciativa privada. Na área de melhoramento genético de peixes, alunos do LAGOAA realizam dissertações de mestrado e teses de doutoramento em empresas de criação de peixes, como a Empresa Brasileira do Peixe Ltda em Jundiaí/São Paulo e a BioFish em Porto Velho/Rondônia. Projetos com a inciativa privada possibilitou o apoio da FAPESP, por meio do programa PIPE – Programa de Inovação Tecnológica em Pequenas Empresas, cujos produtos da pesquisa têm gerado pacotes tecnológicos com a produção de variedades genéticas de tilápia vermelha.

Na área de prestação de serviço conduzimos trabalhos com empresas geradoras de energia elétrica em estudos de avaliação genética populacional de peixes afetados por barramentos.